Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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GEN1Q17RS7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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GEN1Q17RS7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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GEN1Q17RS7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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GEN1Q17RS7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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