Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms