Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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