Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC18A3Q16572 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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