Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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