Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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SEC23BQ15437 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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SEC23BQ15437 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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SEC23BQ15437 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SEC23BQ15437 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SEC23BQ15437 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SEC23BQ15437 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SEC23BQ15437 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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