Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 A2M-212ENST00000545828 471 ntTSL 46.68□□□□□ -1.341e-32■□□□□ 11.1
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PCBP1Q15365 ARF1-208ENST00000478336 930 ntTSL 226.56■■□□□ 1.841e-12■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 ARF1-203ENST00000470558 820 ntTSL 217.33■□□□□ 0.361e-12■□□□□ 11.1
PCBP1Q15365 TMUB1-206ENST00000488752 584 ntTSL 225.02■■□□□ 1.62e-17■□□□□ 11
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PCBP1Q15365 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.298e-9■□□□□ 11
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PCBP1Q15365 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.873e-17■□□□□ 11
PCBP1Q15365 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.413e-17■□□□□ 11
PCBP1Q15365 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.313e-17■□□□□ 11
PCBP1Q15365 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.213e-17■□□□□ 11
PCBP1Q15365 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.143e-17■□□□□ 11
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PCBP1Q15365 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.033e-17■□□□□ 11
PCBP1Q15365 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.033e-17■□□□□ 11
PCBP1Q15365 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.013e-17■□□□□ 11
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PCBP1Q15365 ALDOA-211ENST00000564521 2534 ntTSL 513.13□□□□□ -0.313e-17■□□□□ 11
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PCBP1Q15365 KIZ-205ENST00000611685 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.53■□□□□ 0.241e-8■□□□□ 11
PCBP1Q15365 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.081e-8■□□□□ 11
PCBP1Q15365 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.161e-8■□□□□ 11
PCBP1Q15365 KIZ-210ENST00000619189 2130 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.511e-8■□□□□ 11
PCBP1Q15365 KIZ-207ENST00000616679 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.88□□□□□ -1.151e-8■□□□□ 11
PCBP1Q15365 KIZ-214ENST00000621366 1397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)6.29□□□□□ -1.41e-8■□□□□ 11
PCBP1Q15365 KIZ-209ENST00000619179 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 55.24□□□□□ -1.571e-8■□□□□ 11
PCBP1Q15365 RAD23A-204ENST00000588329 1034 ntTSL 519.84■□□□□ 0.771e-8■□□□□ 11
PCBP1Q15365 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.045e-6■□□□□ 11
PCBP1Q15365 SOX9-201ENST00000245479 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.611e-7■□□□□ 11
PCBP1Q15365 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.081e-11■□□□□ 11
PCBP1Q15365 APOH-203ENST00000581797 748 ntTSL 37.02□□□□□ -1.291e-8■□□□□ 11
PCBP1Q15365 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.361e-8■□□□□ 11
PCBP1Q15365 APOH-202ENST00000577982 707 ntTSL 54.68□□□□□ -1.661e-8■□□□□ 11
PCBP1Q15365 POR-212ENST00000447222 2332 ntTSL 516.85■□□□□ 0.293e-17■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 SND1-213ENST00000486037 695 ntTSL 310.75□□□□□ -0.696e-11■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 SND1-211ENST00000484767 460 ntTSL 49.39□□□□□ -0.916e-11■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 YLPM1-205ENST00000549293 5500 ntTSL 1 (best)7.42□□□□□ -1.226e-11■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 SND1-216ENST00000492840 472 ntTSL 56.79□□□□□ -1.326e-11■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 SYPL1-206ENST00000483448 478 ntTSL 423.91■■□□□ 1.425e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 SYPL1-201ENST00000011473 2127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.295e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 SYPL1-202ENST00000455385 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.535e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.395e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.815e-7■□□□□ 10.9
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PCBP1Q15365 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.145e-7■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.095e-7■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.045e-7■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 GSN-205ENST00000373823 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.415e-7■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.638e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.588e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 CTBP1-214ENST00000514495 564 ntTSL 230.73■■■□□ 2.515e-7■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.378e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ECI1-202ENST00000561688 705 ntTSL 229.78■■■□□ 2.368e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 GPX4-202ENST00000585362 859 ntTSL 229.11■■■□□ 2.258e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.248e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 MBOAT7-214ENST00000495968 465 ntTSL 528.81■■■□□ 2.25e-7■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ECI1-204ENST00000563029 776 ntTSL 228.21■■■□□ 2.118e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.948e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 GPX4-211ENST00000614791 431 ntTSL 326.31■■□□□ 1.88e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.738e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.695e-7■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.638e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ECI1-206ENST00000566379 961 ntTSL 224.5■■□□□ 1.518e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 HNRNPLL-211ENST00000498516 655 ntTSL 324.12■■□□□ 1.458e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.418e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.315e-7■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 MED25-208ENST00000599722 504 ntTSL 323.04■■□□□ 1.288e-6■□□□□ 10.9
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PCBP1Q15365 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.238e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.178e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.098e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 CTBP1-217ENST00000515399 985 ntTSL 321.77■■□□□ 1.085e-7■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.078e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.068e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.038e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.018e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.018e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.018e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.968e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-223ENST00000511662 441 ntTSL 521.02■□□□□ 0.963e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.958e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.939e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.898e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.878e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.868e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 GPX4-209ENST00000593032 583 ntTSL 320.38■□□□□ 0.858e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 CTBP1-208ENST00000506180 843 ntTSL 520.37■□□□□ 0.855e-7■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.838e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.838e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 SAE1-204ENST00000414294 2211 ntTSL 220.18■□□□□ 0.828e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 SAE1-207ENST00000596995 2106 ntTSL 220.09■□□□□ 0.818e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.88e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.87e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.798e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 UGCG-203ENST00000489355 526 ntTSL 219.93■□□□□ 0.788e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.768e-6■□□□□ 10.9
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