Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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BRD3Q15059 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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BRD3Q15059 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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BRD3Q15059 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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