Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms