Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms