Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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