Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NFX1Q12986 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFX1Q12986 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms