Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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