Protein–RNA interactions for Protein: Q06481

APLP2, Amyloid-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP2Q06481 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
APLP2Q06481 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
APLP2Q06481 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms