Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OCA2Q04671 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OCA2Q04671 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OCA2Q04671 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OCA2Q04671 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OCA2Q04671 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
OCA2Q04671 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OCA2Q04671 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OCA2Q04671 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OCA2Q04671 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
OCA2Q04671 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OCA2Q04671 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms