Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB3Q04118 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRB3Q04118 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRB3Q04118 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms