Protein–RNA interactions for Protein: Q00796

SORD, Sorbitol dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORDQ00796 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORDQ00796 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORDQ00796 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORDQ00796 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORDQ00796 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SORDQ00796 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORDQ00796 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORDQ00796 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORDQ00796 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORDQ00796 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORDQ00796 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORDQ00796 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORDQ00796 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORDQ00796 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORDQ00796 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SORDQ00796 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORDQ00796 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORDQ00796 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORDQ00796 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORDQ00796 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORDQ00796 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORDQ00796 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORDQ00796 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORDQ00796 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORDQ00796 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORDQ00796 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORDQ00796 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORDQ00796 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORDQ00796 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SORDQ00796 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SORDQ00796 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SORDQ00796 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SORDQ00796 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SORDQ00796 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms