Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms