Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3BGRP55822 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms