Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DAP3P51398 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DAP3P51398 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms