Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms