Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3CBP42338 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms