Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIPAP38571 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LIPAP38571 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LIPAP38571 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIPAP38571 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LIPAP38571 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LIPAP38571 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LIPAP38571 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPAP38571 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPAP38571 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPAP38571 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPAP38571 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPAP38571 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPAP38571 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPAP38571 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPAP38571 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPAP38571 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPAP38571 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPAP38571 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPAP38571 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPAP38571 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPAP38571 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPAP38571 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPAP38571 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPAP38571 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPAP38571 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPAP38571 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPAP38571 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPAP38571 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIPAP38571 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms