Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC1P33527 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms