Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTF3P20783 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTF3P20783 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NTF3P20783 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NTF3P20783 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NTF3P20783 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NTF3P20783 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NTF3P20783 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NTF3P20783 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NTF3P20783 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NTF3P20783 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NTF3P20783 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NTF3P20783 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTF3P20783 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms