Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL3L1P16619 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms