Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms