Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDH1P12830 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH1P12830 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH1P12830 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDH1P12830 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms