Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2P0DI81 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms