Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN2P0C2S0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms