Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFLP07196 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFLP07196 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFLP07196 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFLP07196 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFLP07196 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFLP07196 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFLP07196 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFLP07196 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFLP07196 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFLP07196 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFLP07196 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFLP07196 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFLP07196 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFLP07196 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFLP07196 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFLP07196 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFLP07196 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFLP07196 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFLP07196 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFLP07196 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFLP07196 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFLP07196 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFLP07196 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFLP07196 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFLP07196 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFLP07196 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFLP07196 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFLP07196 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFLP07196 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFLP07196 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFLP07196 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFLP07196 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFLP07196 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFLP07196 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFLP07196 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFLP07196 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFLP07196 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFLP07196 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFLP07196 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFLP07196 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFLP07196 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFLP07196 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFLP07196 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFLP07196 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFLP07196 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFLP07196 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFLP07196 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFLP07196 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms