Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TBX18O95935 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TBX18O95935 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TBX18O95935 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TBX18O95935 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TBX18O95935 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TBX18O95935 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TBX18O95935 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TBX18O95935 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TBX18O95935 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TBX18O95935 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms