Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F6O75461 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F6O75461 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F6O75461 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F6O75461 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F6O75461 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F6O75461 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F6O75461 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F6O75461 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F6O75461 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F6O75461 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F6O75461 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F6O75461 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F6O75461 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F6O75461 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F6O75461 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F6O75461 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F6O75461 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F6O75461 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F6O75461 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F6O75461 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F6O75461 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms