Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDIL3O43854 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms