Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA2O43364 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA2O43364 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms