Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KNSTRNQ9Y448 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KNSTRNQ9Y448 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms