Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNZ2

NSFL1C, NSFL1 cofactor p47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFL1CQ9UNZ2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSFL1CQ9UNZ2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms