Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE0

EDAR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member EDAR, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDARQ9UNE0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDARQ9UNE0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms