Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms