Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHORDC1Q9UHD1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms