Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms