Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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