Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCMF1Q9P0J7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms