Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
INCENPQ9NQS7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
INCENPQ9NQS7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
INCENPQ9NQS7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
INCENPQ9NQS7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms