Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms