Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FANCFQ9NPI8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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