Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms