Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTNAP4Q9C0A0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms