Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSX2Q9BZM3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSX2Q9BZM3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms