Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms